官军的人马虽然是黄巾军的一倍，但是被甘宁骚扰的疲惫不堪，又因为友军突然撤走，惶恐不安，更因为自己正准备移营，队伍乱了队形。但是再看黄巾军这边，主力人马一直都在休整之中，养精蓄锐，士气高昂，这回冲杀出来，那真是猛虎下山，杀得八万官军尸横遍野，严白虎在一帮子亲兵亲将的护卫下拼死杀出了重围。可是他的弟弟严舆就没那般幸运了，在突围的途中被追上的蒋永一箭射落马下，被千军万马踏作了肉泥。
严白虎虽然冲出了黄巾军的包围，可是往吴郡的道路上已经布满了黄巾军，严白虎那里还能回得去吴郡？当然，也可以去会稽投靠王朗。可是现在的严白虎对王朗是又气又恨又怕，哪里还敢去会稽？只得逃往荒山野岭，再作计较了。
黄巾军不费吹灰之力攻陷了吴郡。
占领吴郡后，下一步就是进军会稽。孙仲为了不给王朗卷土重来的机会，马不停蹄的向会稽进军。
此时的王朗已经是惊弓之鸟，当黄巾军兵临城下的时候，王朗缩在城中，不敢应战。
孙仲挥军猛攻，王朗的四万人马虽然不敢出城应战，可是自守却是绰绰有余，黄巾军一连攻城攻了七八日，却一直攻不下来。孙仲现在最担忧的是，如果袁术和刘表达成了和解，引兵渡江，那他黄巾军可就真真正正的是腹背受敌，首尾不能相顾了。
所以，务必尽快攻陷会稽，以便回兵应天，以应付西面的官军主力。
孙仲与众将商议对策，钱珏道：“主公，会稽的钱粮，大半屯在查渎，离这里不远，可引兵进攻。查渎一失，会稽不难攻下！”
蒋钦问道：“要是这会稽的钱粮不在查渎，那该如何是好？”
钱珏道：“公奕将军，有所不知，会稽的钱粮历来就屯在查渎，而官军此番联合进攻我黄巾军，本意是志在必得，他们没有想到自己会败得这般的快，这般的惨，所以在下料定，王朗的钱粮必然还在查渎。”
周泰听了，拱手道：“在下愿去攻取查渎！”
甘宁道：“大头领，如果王朗的钱粮真在查渎，我军一动，王朗必然出城追赶，就可乘机夺取会稽。”
孙仲看了一眼甘宁，笑道：“那就依照大家伙的计策行事吧。”
当天夜里，四野里一片漆黑。孙仲下令，在四门放起火来，并虚张旗号，布成疑兵。大军撤围向查渎方向进发。
王朗站在城头见了，慌忙请虞翻上城来观望，只见城下一片烟火，旗号一点不乱。王朗心中疑惑，问虞翻道：“这黄巾贼寇又在布什么疑阵？”
虞翻思索片刻，大惊道：“莫......莫非黄巾贼寇去取查渎去了？”
王朗听了这话更是惊得一屁股坐到地上：“一旦查渎有失，那......那会稽可就完了！”
虞翻忙道：“请主公速速发兵去就查渎！”
当下，王朗立即派遣麾下部将周昕，领兵一万火速追赶查渎，自己领兵随后接应。将近初更，周昕领兵经过一座密林，忽然一声鼓响，林中火把齐明，一队人马拦住了官军的去路。周昕知道中计，不敢迎战，勒马回头便跑，不到几步，但见一位威风凛凛的头裹黄巾的大将，横枪立马，拦住退路，这员大将正是周泰。
周昕哪里还敢战，又忙缩头退回。可是如今的周昕前后无路可走，真是上天无路，入地无门，叫天天不应叫地地不灵，正要下马投降时，拦路的领兵大将蒋钦不待周昕求饶，挥刀冲上去，一刀将周昕砍作两段，横尸马下。
一万官军早就心胆俱裂，一见主将阵亡，纷纷跪地求饶。
王朗知道前军已败，不敢迎战，急忙后队变作前队，准备退回会稽。可是当王朗挥刀会稽城边时，高呼开门。城上无人应答，过了良久，只见城头上竖起了一面“孙”字大纛旗，孙仲立在城头笑道：“王朗，你的会稽城我已经笑纳了，你怎么还不下马投降啊？”
王朗一见会稽失守，悔之无及，没有办法，麾下的兵士见王朗大势已去，纷纷跪地投降。王朗当然不愿意做黄巾贼寇的阶下囚，引着心腹人马逃往海边去了。
孙仲取了会稽，首先分田分地。当然，如果有世家大族愿意支持他们黄巾军是最好，所以在攻占会稽时，擒获了虞翻，所以虞翻能够首先归降，也可以给江东的世家大族做个表率。于是他去监牢中请出虞翻，希望虞翻能够归顺。
虞翻虽然是世家大族，可是他也怕死，也怕落个灭门的下场。当孙仲亲自请他出牢的时候，他就抱定了一个心思，既不投降孙仲，也不激怒孙仲。
所以无论孙仲如何劝降，虞翻都是恭恭敬敬的委婉拒绝。
孙仲劝说了虞翻一个多时辰，而虞翻始终是推诿敷衍。孙仲终于安奈不住心中的怒火，妈的，有什么了不起！死了张屠户，老子还要吃连毛猪不成！但面上却不动声色，只是语气中满是杀意的道：
“仲翔先生，你就真的不为自己和家人的安危着想吗？”
虞翻知道迟早是会激怒孙仲的，于是强作镇定道：“孙头领，如果靠着杀戮就能得天下，如今刘汉的江山恐怕已经改姓董了。”虞翻话语的意思是当初董卓不就是想仗着西凉兵强马壮与杀戮来震慑拉拢世家大族吗？最后怎么样？你今天孙仲这么干，不过是重复董卓的老路而已。
孙仲不想杀人，也不愿意杀人，特别是现在西面还有几十万官军压境，而吴郡和会稽的田地还没有分配，百姓还不归附的情况下，更不能杀人。可是虞翻将话都说到这一步了，不就是在诅咒自己会成为下一个董卓吗？他听了虞翻的话，冷冷一笑，没有回话，而是将虞翻又关押了起来。
孙仲留下周泰镇守会稽，镇压叛乱，又调去董俊主持分田；派遣蒋钦镇守吴郡，并调来宋景主持分田。自己统帅大军返回应天，准备对庐江的官军发动进攻。